Juhannuskokon paikkaa valittaessa tulisi ottaa huomioon linnut ja muu luonto, muistutetaan BirdLife Suomesta. Juhannuksen tienoilla monilla vesi- ja rantalinnuilla on pesintä vielä kesken.

Kokkoa ei tule sijoittaa lintuluodoille. Parhaita pesimäluotoja ovat yleensä pienet vähäpuustoiset tai puuttomat luodot. Lintujen pesät ja munat ovat hyvin naamioituja ja aikuislintujen oleskelu luodoilla juhannuksen aikaan on varma merkki pesinnästä, vaikka yhtään pesää ei näkyisikään. BirdLife Suomi vetoaakin juhlijoihin ja kokon rakentajiin, ettei lintuluodoille noustaisi tai rakennettaisi kokkoa.